В 1559 г. инфанта Хуана Габсбургская решил оставить мир ради тихой монашеской обители, для которой был выбран ренессанс-ный особняк в предместье Сан-Мартин, располагавшемся между современными улицами Гран Виа и Аренал в этом особняке принцесса родилась . По совету его духовного отца, герцога Борджиа, в новоустроенный монастырь были приглашены "босоногие" монахини-клариссы, члены Ордена, основанного Св. Кларой Ассизской, сподвижницей Св. Франциска.
Работы по приспособлению дворца под обитель, которую стали называть королевским монастырем "босоножек", произвели зодчие Антонио Сильеро и Хуан Баутиста де Толедо в 1559-64 гг. Здание, включая интерьеры, приобрело характерный для вкусов той эпохи сдержанный классический облик, значительно изменненый с приходом барокко.
Монастырский храм, пострадавший от неоднократных пожаров, сохранил, тем не менее, многочисленные произведения искуства. В главном алтаре - ретабло, исполненное в начале XVIII в. миланским скульптором Камилло Рускони, работавшим для Филиппа V, и богородичный образ, по преданию, чудотворный. В небольшой капелле, справа от пресбитерия, - мраморный надгробный памятник инфанты Хуаны, работы итальянца Помпео Леони.
Часть залов монастыря, в котором до сих пор живут клариссы, обращена в музей. Посетители сперва попадают к роскошной лестнице, которая сразу напоминает о том, что эта обитель - королевская. Великолепные ложные перспективы на сводах появились в XVII в. Далее следует Зал выборов, где монахини раз в четыре года выбирают игуменью; залы с живописью немецкая, итальянская и испанская школа; работы Тициана, Сурбарана. Ван Дейка ; зал с портретами инфантов, имеющих атрибуты их Небесных покровителей один принц изображен даже в виде Иисуса-младенца ; клуатр, на верхнем этаже которого - множество капелл, т.к. вновь поступавшие монахини утраивали тут, по традиции, свои "приватные" часовни.